More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2865 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  97.01 
 
 		 135 aa  267  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  96.27 
 
 		 135 aa  266  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  79.85 
 
 		 134 aa  223  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  79.85 
 
 		 134 aa  223  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  79.85 
 
 		 134 aa  223  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  79.85 
 
 		 134 aa  223  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  79.1 
 
 		 134 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.8 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  29.81 
 
 		 172 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  35.9 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  30.4 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0100  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  30.4 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28.85 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  41.03 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  35.87 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  26.73 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 172 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  35.9 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>