248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4283 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 176 aa  357  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  45.56 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 150 aa  104  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 169 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 315 aa  88.2  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 178 aa  87.8  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  30.83 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.64 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  36.67 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 136 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 244 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 223 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 336 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 326 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 158 aa  51.2  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  26.79 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 303 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 143 aa  48.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  30.43 
 
 		 152 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 139 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>