More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_05520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  97.28 
 
 		 147 aa  285  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  29.2 
 
 		 177 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  34.58 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 172 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.36 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  30.47 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  30.47 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  30.47 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  30.47 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  30.47 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  30.3 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  30.08 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  31.3 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 304 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1876  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 176 aa  52  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 326 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>