More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1876 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1876  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  295  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 184 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  34.62 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  31.11 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  34.85 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  31.58 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  32.54 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  31.39 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.34 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  29.9 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  35.85 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  42.31 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  35.71 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 193 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  28.7 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  24.72 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>