133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2391 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  100 
 
 		 143 aa  289  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 186 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 186 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0090  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0096  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  29.5 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  30.08 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 326 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 340 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 340 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  29.27 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 320 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 309 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  24.11 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0521  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 347 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 349 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.32 
 
 		 349 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  29.29 
 
 		 283 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  23.66 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  22.63 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 205 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 154 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 150 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  24.51 
 
 		 156 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 152 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  31.76 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>