More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0524 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  100 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  97.28 
 
 		 147 aa  285  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.36 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  34.58 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  29.29 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  28.44 
 
 		 177 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  30.3 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  29.69 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  29.69 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  29.69 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  29.69 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  29.69 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 304 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  31.3 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1876  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  29.73 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 183 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>