211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1722 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  373  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  29.32 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  30.51 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  26.12 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  28.67 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  25.36 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 303 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  24.29 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  28.47 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 315 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  23.91 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  29.81 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 205 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 150 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  28.8 
 
 		 147 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  23.91 
 
 		 171 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.02 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  28 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  23.08 
 
 		 139 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  27.12 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 149 aa  48.5  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  48.5  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04625  transcriptional regulator MarR family  27.93 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  22.22 
 
 		 139 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  28 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3789  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379829  hitchhiker  0.00361313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>