More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2558 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  332  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  95.76 
 
 		 165 aa  320  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  95.76 
 
 		 165 aa  320  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  95.76 
 
 		 165 aa  320  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  95.76 
 
 		 165 aa  320  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  95.76 
 
 		 165 aa  320  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  95.76 
 
 		 165 aa  320  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  95.76 
 
 		 165 aa  320  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  81.37 
 
 		 163 aa  263  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  81.37 
 
 		 163 aa  262  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  81.37 
 
 		 163 aa  262  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  81.37 
 
 		 163 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  80.5 
 
 		 164 aa  253  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  84.93 
 
 		 164 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  79.87 
 
 		 164 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  69.14 
 
 		 172 aa  222  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  67.9 
 
 		 171 aa  218  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  65.84 
 
 		 171 aa  215  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  47.01 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  47.76 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  48.2 
 
 		 178 aa  120  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 195 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  41.83 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 177 aa  97.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 180 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 185 aa  95.5  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 145 aa  94.4  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 180 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 		 156 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 157 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  33.33 
 
 		 177 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 162 aa  87.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  37.31 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  39.52 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  32.89 
 
 		 161 aa  84.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.85 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1284  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.155543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6557  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  30.53 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>