More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1878 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  29.53 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  28.12 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  48.94 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  31.13 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.75 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  32.5 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  27.5 
 
 		 191 aa  51.2  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  29.82 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>