More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4687 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  327  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  71.03 
 
 
145 aa  217  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  73.79 
 
 
145 aa  216  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  68.31 
 
 
150 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  64.34 
 
 
145 aa  195  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  62.68 
 
 
177 aa  187  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  55.86 
 
 
145 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  49.29 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  47.74 
 
 
177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
165 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
165 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
165 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
165 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
165 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  48.89 
 
 
180 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
180 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 
181 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  42.86 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 
162 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 
162 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  38.46 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
178 aa  97.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
178 aa  97.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
195 aa  97.4  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  39.53 
 
 
147 aa  94  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
157 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 
178 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
158 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  35.66 
 
 
162 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 
156 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  36.18 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
163 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
165 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
163 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
165 aa  84.3  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
157 aa  84  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
193 aa  77.4  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  41.44 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  41.44 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  41.44 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  41.44 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  41.44 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  41.44 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  40 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.84 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.13 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.13 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.13 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.13 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.13 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.23 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  36.5 
 
 
143 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
146 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 
141 aa  61.6  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  32.41 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 
183 aa  60.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>