More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0324 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
164 aa  330  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  63.16 
 
 
171 aa  175  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  63.16 
 
 
171 aa  174  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  54.68 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  55.71 
 
 
195 aa  143  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  57.66 
 
 
178 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  57.55 
 
 
185 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
178 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
165 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
165 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
165 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
165 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
163 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
165 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
165 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
165 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
165 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
163 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
163 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
163 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
164 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
164 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 
171 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  44.53 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  42.42 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
162 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
162 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
162 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
162 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  38.61 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 
177 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  41.67 
 
 
177 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  39.71 
 
 
150 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
163 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 
162 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 
162 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  37.33 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  35.77 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  33.82 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  42.99 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  28.99 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  28.99 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  28.99 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  28.26 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  28.26 
 
 
144 aa  62.4  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>