More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4023 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
145 aa  291  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  58.62 
 
 
145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  58.74 
 
 
145 aa  167  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  58.45 
 
 
177 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  55.24 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  55.86 
 
 
161 aa  161  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  55.71 
 
 
150 aa  156  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
162 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
162 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
162 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
163 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
162 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
180 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
165 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
165 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
165 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
165 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
165 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  39.29 
 
 
177 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 
180 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
163 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
181 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
165 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
178 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  36.55 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 
172 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
163 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
163 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  35.17 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  37.12 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  31.47 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  32.87 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  45.16 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  34.81 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
171 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  35.56 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
193 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
157 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
303 aa  52  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  30.23 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  35.16 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
145 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>