More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3950 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
180 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  94.97 
 
 
180 aa  345  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  64.97 
 
 
162 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  64.97 
 
 
162 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  64.97 
 
 
162 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  64.33 
 
 
163 aa  190  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  65.61 
 
 
162 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  65.61 
 
 
162 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  64.97 
 
 
162 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  67.61 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  67.61 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  67.61 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  67.61 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  67.61 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  67.61 
 
 
177 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  66.9 
 
 
163 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  65.13 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 
145 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  41.73 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  43.88 
 
 
150 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  43.57 
 
 
145 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  48.89 
 
 
161 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  41.1 
 
 
159 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 
162 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 
162 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
145 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  38.71 
 
 
162 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
160 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
171 aa  98.6  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
158 aa  98.2  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 
149 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  36.84 
 
 
162 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
171 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
164 aa  94.4  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  40.88 
 
 
171 aa  94.7  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
165 aa  94  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  38.52 
 
 
147 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
163 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  34.57 
 
 
156 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
163 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
163 aa  92  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
163 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
157 aa  91.7  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  38.19 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
193 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
157 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
157 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
157 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  35 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  34.46 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  35.59 
 
 
143 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.59 
 
 
152 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 
139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
168 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 
139 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
164 aa  62  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.01 
 
 
144 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.01 
 
 
144 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.01 
 
 
144 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.01 
 
 
144 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.01 
 
 
144 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 
162 aa  61.6  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
149 aa  61.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
140 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>