More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  296  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  68.24 
 
 		 152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  67.11 
 
 		 152 aa  194  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  59.18 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 214 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  34.53 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  32.31 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  33.33 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  28.07 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  30.66 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  31.67 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  28.03 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3478  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00929426  hitchhiker  0.00647977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  32.31 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  27.34 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  30.94 
 
 		 177 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 193 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 164 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>