38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3478 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3478  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  288  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00929426  hitchhiker  0.00647977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2394  transcriptional regulator, MarR family  72.41 
 
 		 148 aa  204  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.629641  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3789  transcriptional regulator, MarR family  63.91 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379829  hitchhiker  0.00361313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4641  hypothetical protein  51.26 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2393  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  27.07 
 
 		 160 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 160 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 174 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 160 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 160 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 160 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 160 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  28.46 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3891  hypothetical protein  25.2 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0092  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 147 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>