More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2008 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  279  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  51.13 
 
 		 148 aa  130  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  46.62 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  46.09 
 
 		 214 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  40.58 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  35.58 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  34.31 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  28.12 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  31.93 
 
 		 175 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  29.32 
 
 		 172 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  35.14 
 
 		 157 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 176 aa  50.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  30.71 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 303 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  29.29 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>