180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4007 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  361  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  56.25 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  56.25 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  55.94 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  52.35 
 
 		 158 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  56.83 
 
 		 145 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 214 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  38.97 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 149 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  38.97 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  32.56 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 158 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  30.4 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  31.36 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  34.76 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  32.73 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 139 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  29.93 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  32.32 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 303 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3865  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115918  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 136 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 163 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 151 aa  47.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  30.16 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  25.61 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  37.04 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 128 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 407 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 151 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  43.1 
 
 		 407 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>