More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5379 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  100 
 
 
162 aa  332  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  42.75 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 
214 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  34.53 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  35.16 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
142 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  33.93 
 
 
145 aa  61.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
167 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
158 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  31.53 
 
 
158 aa  57.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 
171 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 
171 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  32.03 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  33.33 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
193 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
303 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
174 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
151 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  29.73 
 
 
169 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
143 aa  54.3  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
167 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  30.47 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  31.58 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
139 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  31.96 
 
 
154 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  25.95 
 
 
157 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
174 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  25 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
151 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
175 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  27.62 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
153 aa  50.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  27.27 
 
 
177 aa  50.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
156 aa  50.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>