More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1409 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 201 aa  140  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  34.85 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  29.86 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  34 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.04 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  31.58 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.6 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.6 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  33.98 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  29.3 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  32.43 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  30.56 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  38.55 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 150 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>