More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4809 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  321  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  85.71 
 
 		 161 aa  275  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  54.49 
 
 		 172 aa  160  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 171 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  37.58 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  38 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  32 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  28.57 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.13 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  31.73 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  31.73 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  31.73 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  31.73 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  34.71 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30.47 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  35.48 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  31.25 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  26.95 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  32.2 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  23.58 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3454  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.947902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  25.19 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  29.82 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>