239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03706 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  100 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  81.16 
 
 		 139 aa  235  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  81.16 
 
 		 139 aa  235  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1151  MarR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 138 aa  167  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  53.62 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  53.62 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  51.45 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1138  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.518739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0194  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1561  transcriptional regulator  26.45 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  41.25 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 		 172 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 163 aa  50.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 193 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.11 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.64 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  31.91 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.11 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  25.55 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  37.18 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.85 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  38.2 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  26.44 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2187  hypothetical protein  30.4 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0800441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.68 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>