155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1151 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1151  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
138 aa  287  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  56.2 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  56.2 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  56.93 
 
 
138 aa  168  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  56.52 
 
 
139 aa  167  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  53.62 
 
 
139 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  53.62 
 
 
139 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
138 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0194  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1138  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.518739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
191 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
177 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
182 aa  52  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
148 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
150 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
171 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  23.16 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  23.16 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  23.16 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  23.16 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  23.16 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  34.21 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
174 aa  47.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1561  transcriptional regulator  29.33 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
142 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
142 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 
140 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
205 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  36.89 
 
 
149 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 
172 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  30.97 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  36.99 
 
 
147 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  24.18 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
179 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  31.52 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  31.43 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
177 aa  44.7  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  26.32 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
162 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  25.81 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  25.81 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  26.44 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  32.58 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  27.19 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
143 aa  42.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
165 aa  42.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  23.89 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>