44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1561 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1561  transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  288  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 
156 aa  89  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0194  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 
155 aa  83.6  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1138  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.518739  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  27.61 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  26.45 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1151  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
166 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
180 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  48.89 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.65 
 
 
325 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  23.62 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  23.62 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
167 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  27.91 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  22.88 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  22.54 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
137 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  38.71 
 
 
174 aa  40  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>