More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01812 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  100 
 
 		 158 aa  317  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 181 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  55.19 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 158 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 157 aa  187  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 157 aa  187  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  54.49 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  54.55 
 
 		 161 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  55.03 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  53.85 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 159 aa  173  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  50.32 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  46.98 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  44.08 
 
 		 191 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  45.19 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  45.07 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 182 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 187 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  35.46 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 154 aa  87.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  31.79 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  31.88 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  27.33 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  30.28 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  39.78 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  29.8 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  43.42 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 310 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  38.95 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>