245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2948 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  305  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  56.33 
 
 		 182 aa  167  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  39.46 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  34.67 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  35.57 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  40.14 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  38.73 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  38.51 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 		 191 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  37.16 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  36.23 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 148 aa  90.9  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  34.44 
 
 		 187 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  33.08 
 
 		 135 aa  86.3  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  36.89 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  36.89 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  30.52 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  37.88 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  34.69 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.29 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 310 aa  47.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2675  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>