More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4318 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1674  transcriptional regulator, MarR family  44.53 
 
 		 173 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  32.37 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  25.55 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  32.76 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  32.71 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  30.71 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  34.53 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  29.3 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  30 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  35.29 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  26.28 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 143 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 143 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>