More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3804 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 176 aa  91.7  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  41.67 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  27.74 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  30.7 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  31.33 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  35.06 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  29.3 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  27.64 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1031  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 149 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18960  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0870752  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  35.88 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  35.23 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  28.72 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  20.78 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  32.69 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  32.69 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  32.69 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  32.69 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  32.69 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  31.25 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  33.8 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  27.52 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  27.52 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  27.52 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  31.33 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>