166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0548 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  288  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1031  MarR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 167 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 214 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0464  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  30.23 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  30.68 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2290  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000698981  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2332  regulatory protein MarR  43.64 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 176 aa  44.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  26.67 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  25.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  25.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  32.32 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  25.19 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  25.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  25.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  25.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  25.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  28.92 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  29.91 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  32.39 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  28.92 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  28.92 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  28.57 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  28.57 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  28.92 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  28.92 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  28.57 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  20.3 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  28.92 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  28.57 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  28.71 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  28.57 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  28.92 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.92 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 323 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  28.4 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 140 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 148 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 142 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>