More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2581 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  339  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  58.39 
 
 
176 aa  169  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
167 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  28.66 
 
 
167 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  34.64 
 
 
175 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1031  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  34.46 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  28.66 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  32.81 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  26.11 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
167 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  28.57 
 
 
163 aa  61.6  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 
144 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
161 aa  61.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
186 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
144 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
152 aa  60.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
155 aa  60.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 
151 aa  60.8  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
212 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
212 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
212 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
212 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  29.41 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
212 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3623  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
212 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  32 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29.01 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  32.14 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  32.14 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
192 aa  58.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  32.14 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  32.14 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  32.14 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  32.14 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  32.14 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  32.14 
 
 
176 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  31.58 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  31.58 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  31.58 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
212 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  34 
 
 
176 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  34 
 
 
176 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  34 
 
 
176 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  34 
 
 
176 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  34 
 
 
176 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
159 aa  57.4  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
191 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
137 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  27.15 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 
149 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  28.57 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  29.66 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>