More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3772 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  56.42 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  54.19 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  55.31 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 190 aa  154  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  40.11 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 191 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.99 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  26.37 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 147 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  31.4 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 148 aa  48.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 169 aa  48.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  28.87 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  41.67 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  39 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  38.57 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  30.69 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  37.88 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  35.21 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  29.91 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  34.62 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  34.29 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 155 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1325  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.452176  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  33.87 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  40.35 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 138 aa  45.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1520  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.854006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>