40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1520 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1520  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
158 aa  319  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.854006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1365  transcriptional regulator, MarR family  78.85 
 
 
156 aa  254  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1376  transcriptional regulator, MarR family  78.85 
 
 
156 aa  254  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1422  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 
174 aa  94  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.40162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1400  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1389  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000012285  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1264  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1536  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1325  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.452176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1428  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
145 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1525  transcriptional regulator, putative  26.98 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  22.54 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1381  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 
184 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  27.36 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  30.16 
 
 
139 aa  43.9  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
139 aa  43.9  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  23.66 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
190 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3592  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.568766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 
150 aa  40.8  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  20.83 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  22.03 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  21.28 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  21.28 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  22.14 
 
 
186 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 
145 aa  40.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>