108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5106 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 206 aa  430  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 145 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  34.24 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 270 aa  88.2  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 270 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 270 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 270 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 270 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  23.46 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  25.57 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  26.14 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 152 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 322 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  26.27 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 155 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.49 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 340 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 313 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 159 aa  45.4  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 154 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 326 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 340 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 309 aa  45.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 139 aa  45.1  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 352 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  26.03 
 
 		 158 aa  44.7  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  25 
 
 		 140 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  27.43 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  35.44 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0550  regulatory protein, MarR  27.17 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0117945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 320 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 347 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 153 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 167 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 		 152 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  30.77 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 144 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 212 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 212 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  28.17 
 
 		 151 aa  41.6  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  41.6  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>