218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1826 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 141 aa  269  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  43.51 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  46.85 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  44.14 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  35 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  45.21 
 
 		 197 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  32.85 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  40.23 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  35.56 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 183 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  45.45 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  41.67 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  40.15 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  41.58 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 212 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 212 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 212 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.94 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  37.33 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  33.8 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  43.37 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 176 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 176 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 189 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  41.43 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  50 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 195 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>