26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2233 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 151 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 191 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  26.43 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  28.32 
 
 		 324 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>