99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0658 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  85.48 
 
 		 189 aa  298  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  42.94 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 145 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  35.34 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  28.4 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 270 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 270 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 270 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 270 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  27.71 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 270 aa  51.6  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  39.25 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 163 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  33.67 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 178 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 179 aa  44.7  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  32.38 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.6 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 138 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  34.88 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 163 aa  42  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 165 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 165 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 174 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 165 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 165 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 165 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 165 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 163 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  30.15 
 
 		 154 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 164 aa  41.6  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 162 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 161 aa  41.2  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 149 aa  41.2  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 144 aa  41.2  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>