121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0069 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  426  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  426  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  96.7 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  94.81 
 
 		 212 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  94.81 
 
 		 212 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  94.81 
 
 		 212 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  91.51 
 
 		 212 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  87.2 
 
 		 270 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  85.78 
 
 		 270 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  84.83 
 
 		 213 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  84.83 
 
 		 270 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  84.83 
 
 		 270 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  84.83 
 
 		 270 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  80.57 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  80.57 
 
 		 212 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  79.62 
 
 		 212 aa  349  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  85.86 
 
 		 200 aa  346  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  85.86 
 
 		 200 aa  346  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  45.5 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  32.45 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  32.45 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  27.33 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  26.49 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  28.49 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  29.8 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 161 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 143 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 150 aa  52  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 156 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  31.88 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  39.09 
 
 		 142 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 153 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 135 aa  48.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  28.45 
 
 		 146 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3108  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1440  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 172 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  38.53 
 
 		 140 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  34.88 
 
 		 171 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  27.78 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  36.36 
 
 		 162 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 146 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 154 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 174 aa  45.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 152 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1265  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 163 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000976075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 171 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 171 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 146 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 140 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 148 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 139 aa  45.1  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 151 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  35.56 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 137 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 159 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 159 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 180 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  35.16 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 151 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 151 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>