96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2690 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  381  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  43.96 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 189 aa  127  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  26.18 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  32.93 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 138 aa  45.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  30.58 
 
 		 157 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  25.55 
 
 		 141 aa  45.1  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  31.76 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  32.67 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  32.93 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.96 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  35.53 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  32.67 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  32.67 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  32.67 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  32.67 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  25.67 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  41.18 
 
 		 158 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  34.48 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0509  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 150 aa  42  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 193 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0521  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 150 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 145 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 158 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 158 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 187 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  30.16 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  44.68 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 160 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 175 aa  41.2  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 141 aa  41.2  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 163 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 160 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 160 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  27.71 
 
 		 160 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>