203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0337 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  383  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  34.04 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  25.69 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  32.38 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 314 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 140 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  38.2 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 325 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4468  transcriptional regulator, TrmB  29.29 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160154  normal  0.0294539 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 150 aa  48.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 168 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 321 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  34.15 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  32.59 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 326 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 326 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.11 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.11 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 336 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>