More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2739 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  46.53 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.15 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.34 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  26.52 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  30.87 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  32.69 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  31.43 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  30.2 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  33.67 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  28.18 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  24.46 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  31.67 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  26.62 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  28.77 
 
 		 287 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>