More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0503 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 171 aa  347  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  97.08 
 
 		 171 aa  337  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  81.44 
 
 		 178 aa  275  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  37.91 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  37.75 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  39.29 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  36.84 
 
 		 157 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 167 aa  95.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  37.31 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  32.52 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 151 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 163 aa  84.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 161 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  28.47 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  30.15 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  42.17 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 303 aa  64.3  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  33.03 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  31.67 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  28.68 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  31.25 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.29 
 
 		 287 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>