236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0795 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  345  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  40.76 
 
 		 178 aa  98.2  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 158 aa  92  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  35.21 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  35.54 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  36.24 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  37.5 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  31.62 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  30.7 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  30.83 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  33.96 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  30.77 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  29.23 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  34.38 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  43.04 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  35.71 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  43.04 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 146 aa  47.8  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  31.88 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>