More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3119 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  69.66 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 151 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  64.24 
 
 		 197 aa  190  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  60.99 
 
 		 163 aa  186  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  58.6 
 
 		 166 aa  184  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  38.41 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  34.9 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 184 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  34.39 
 
 		 161 aa  93.6  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  36.43 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 171 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  30.99 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  39.1 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  37.29 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  29.05 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  28.29 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  30 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  32.04 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.53 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.86 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  34.27 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  32.99 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 326 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  33.7 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 336 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 176 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  26.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  32.38 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>