More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0660 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  348  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 190 aa  154  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 178 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 157 aa  98.6  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 162 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 153 aa  97.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 172 aa  92  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.87 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  34.07 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  31.88 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  34.62 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  31.16 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  31.16 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  31.16 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  31.16 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  35.11 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  40.8 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  28.28 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  46.48 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  41.89 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  30.08 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.46 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>