More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_14420 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  316  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  71.43 
 
 		 162 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 156 aa  213  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  68.83 
 
 		 162 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  75.37 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  74.63 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 167 aa  150  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  37.91 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  36.6 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  35.95 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 197 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 171 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 170 aa  90.5  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 163 aa  90.5  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 172 aa  90.5  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  38.69 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  37.21 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  30.88 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  33.57 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  35.45 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  33.57 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  27.63 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  31.4 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  32.62 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  32.62 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  32.62 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  32.62 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  32.62 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  32.62 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  32.62 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  32.62 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  32.62 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  32.62 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  32.62 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  32.5 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  32.5 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  32.5 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  32.5 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  32.5 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  31.91 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  31.91 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.99 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>