More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2508 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  324  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  69.44 
 
 		 148 aa  213  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  69.44 
 
 		 148 aa  213  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  69.44 
 
 		 148 aa  213  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  67.12 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  63.09 
 
 		 157 aa  193  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 158 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 158 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  61.44 
 
 		 152 aa  191  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  61.27 
 
 		 154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  61.81 
 
 		 158 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  63.38 
 
 		 158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  55.03 
 
 		 160 aa  167  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 180 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  29.37 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  29.37 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  29.37 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  29.37 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  29.37 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 303 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  31.73 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  30 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  24.84 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  30.7 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  23.84 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>