More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4156 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  284  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 
158 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  46.32 
 
 
144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  47.97 
 
 
167 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  45.39 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  43.45 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  44.2 
 
 
159 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  39.72 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 
154 aa  93.6  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 
149 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  39.57 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
184 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
172 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.67 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
157 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
244 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  42.39 
 
 
145 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
158 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
190 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
174 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
158 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  36.89 
 
 
177 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 
180 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  32.28 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.68 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.08 
 
 
287 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
158 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  29.85 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  29.85 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
172 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  29.85 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  29.85 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
315 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  29.85 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  27.08 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  28.12 
 
 
150 aa  53.9  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
188 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
170 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  29.45 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
205 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  31 
 
 
168 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  40.48 
 
 
168 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
167 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
165 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
156 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.82 
 
 
157 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  26.79 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  35.21 
 
 
172 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  27.19 
 
 
324 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
303 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
146 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
160 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  28.35 
 
 
160 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
160 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>