214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01757 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  306  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  80.54 
 
 		 151 aa  254  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1554  regulatory protein MarR  34.59 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 191 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  26.89 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  31.18 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 167 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  31.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  27.56 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28.45 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  31.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  31.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  31.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  31.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  31.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  31.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  31.07 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  31.07 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  29.84 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2094  regulatory protein MarR  23.7 
 
 		 219 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  26.72 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  31.03 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  24.21 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  29.13 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  29.13 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  29.13 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  24.35 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>