More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0630 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  380  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  63.23 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  41.26 
 
 		 169 aa  95.1  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  40.29 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 193 aa  88.2  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 143 aa  84.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  38.97 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 144 aa  72  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 303 aa  71.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0927  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  42.53 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  39.55 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  41.49 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  44.55 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  42.71 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.71 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  34.46 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  47.83 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  41.25 
 
 		 140 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 167 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  36.45 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  37.78 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 140 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  37.35 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  45 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  31.03 
 
 		 144 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  32.67 
 
 		 139 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  35.35 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  41.18 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 163 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 160 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 160 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.06 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 156 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 149 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 143 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 143 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 148 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  29.85 
 
 		 168 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 150 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>