More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0927 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0927  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 176 aa  339  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  49.41 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  41.72 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  43.97 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  48.25 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 		 144 aa  99  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 244 aa  88.6  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  45.63 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  43.82 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  43 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  37.63 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  41 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  36.09 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  34.45 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  46.05 
 
 		 140 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 307 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  30.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  33.85 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 303 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  29.84 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  29.84 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  29.84 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  34.41 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 157 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 158 aa  51.2  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  36.11 
 
 		 172 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 148 aa  50.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  35.78 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  29.84 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  37.84 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  33.04 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  34.15 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>