More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1068 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 164 aa  329  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  42.04 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  42.11 
 
 		 169 aa  84  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.85 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  41.05 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.83 
 
 		 287 aa  64.3  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 244 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  48.05 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  40.86 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  32.3 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  32.37 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  30.71 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  31.11 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  30.71 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  32.06 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  30.37 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  36.36 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1599  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>